Jak działają nowe testy koronawirusa?

Jeśli obudzisz się pewnego ranka z gorączką, dusznością i kaszlem - innymi słowy, objawami nowego koronawirusa - prawdopodobnie będziesz się zastanawiać, jak możesz się na niego przetestować i co to za sobą pociąga.

Jeśli jesteś w Stanach Zjednoczonych, istnieje prawdopodobieństwo, że pracownik służby zdrowia użyje długiej końcówki Q do wymazu z gardła, a następnie odeśle tę próbkę do badania. Jeśli jesteś w kraju, który opracował test na obecność przeciwciał, takim jak Chiny, możesz pobrać krew.

To, co dzieje się obok tych próbek, jest bardzo różne. Wymaz z gardła dobrze nadaje się do testowania reakcji łańcuchowej polimerazy, znanej również jako PCR, podczas gdy próbka krwi zostanie wydobyta pod kątem przeciwciał swoistych dla nowej choroby, znanej jako COVID-19.

Oba testy trwają zaledwie kilka godzin, co oznacza, że ​​wyniki mogą być gotowe w ciągu jednego dnia, powiedział dr Amesh Adalja, specjalista chorób zakaźnych i starszy uczony w Centrum Bezpieczeństwa Zdrowia Johns Hopkins w Baltimore. Jednak po utworzeniu szybkiej formy tych testów PCR i przeciwciał wyniki mogą być gotowe w niecałą godzinę, powiedział.

„Istnieją szybkie testy PCR, ale nie są jeszcze dostępne” dla nowego koronawirusa w Stanach Zjednoczonych, Adalja powiedziała Live Science.

Testy COVID-19 opracowane przez Centers for Protection and Disease Control (CDC), a także testy opracowane w Waszyngtonie i Nowym Jorku, są testami PCR.

Testy PCR działają poprzez wykrywanie określonego materiału genetycznego w obrębie wirusa. W zależności od rodzaju PCR pod ręką pracownicy służby zdrowia mogą wymazać gardło; pobrać próbkę śliny; pobrać próbkę płynu z dolnych dróg oddechowych; lub zabezpieczyć próbkę kału.

Gdy próbka dotrze do laboratorium, naukowcy wydobywają kwas nukleinowy, który przechowuje genom wirusa. Następnie badacze mogą amplifikować niektóre regiony genomu za pomocą techniki znanej jako reakcja łańcuchowa polimerazy z odwrotną transkrypcją. To w efekcie daje badaczom dużą próbkę, którą mogą następnie porównać z nowym koronawirusem, znanym jako SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 ma prawie 30 000 nukleotydów, elementów budulcowych tworzących DNA i RNA. Test PCR opracowany przez University of Washington School of Medicine (UW Medicine) obejmuje zaledwie 100 nukleotydów specyficznych dla SARS-CoV-2, dr Alex Greninger, adiunkt na Wydziale Medycyny Laboratoryjnej i asystent dyrektora Clinical Virology Laboratory w UW Medicine, powiedział The Seattle Times.

Te 100 nukleotydów obejmuje dwa geny w genomie SARS-CoV-2. Próbka jest uważana za pozytywną, jeśli test wykryje oba geny, co nie jest jednoznaczne, jeśli znaleziono tylko jeden gen, i ujemną, jeśli żaden gen nie zostanie wykryty.

Testy z UW Medicine, które są albo niejednoznaczne, albo pozytywne, są wysyłane do waszyngtońskich Laboratoriów Zdrowia Publicznego i CDC w celu dalszych testów, donosi The Seattle Times.

Natomiast testy serologiczne szukają swoistych przeciwciał, które organizm wytworzył w celu zwalczania wirusa. „Jeśli wykryją te przeciwciała, daje wynik pozytywny” - powiedziała Adalja. Jak donosi magazyn Science, Singapur opracował eksperymentalny test przeciwciał na COVID-19, a według licencji STAT News Chiny też wydały kilka licencji.

Test serologiczny jest korzystny, ponieważ może wykryć przeciwciała, nawet jeśli pacjent wyzdrowiał, podczas gdy test PCR może wykryć wirusa tylko wtedy, gdy dana osoba jest obecnie chora. Jednak oba testy mogą pomijać przypadki, jeśli próbki zostaną pobrane zbyt wcześnie, gdy poziom wirusa jest zbyt niski lub jeśli ciało osoby nie wytworzyło jeszcze przeciwciał przeciwko wirusowi, powiedziała Adalja.

W przypadku testu serologicznego może minąć około tydzień, zanim organizm wytworzy wystarczającą liczbę przeciwciał, chociaż „w miarę otrzymywania kolejnych testów serologicznych pojawią się wytyczne dotyczące ram czasowych niezbędnych do wykonania testu serologicznego”, powiedziała Adalja.